Опыт работы в банковской сфере – более 14 лет.
С января 2002 года — директор банка «Дальневосточное ОВК».
В конце 2004 года возглавил проект по развитию и реструктуризации Амурпромстройбанка. Проект был реализован в 2006 году выходом банка на рынок под новым брендом — Азиатско-Тихоокеанский Банк.
С марта 2006 года Е. В. Аксёнов – председатель правления «Азиатско-Тихоокеанского Банка» (ОАО).