Президент США Барак Обама назначил Чопру на новую должность в мае 2009 года. Чопра сосредоточился на технологической политике Белого дома. Он работал над модернизацией ИТ-инфраструктуры правительства США, продвигал безопасную общенациональную широкополосную сеть, участвовал в разработке политик интернета и способствовал реализации стратегии президента Обамы в отношении открытости управления государством.
В сентябре 2009 года Обама отметил, что Чопра «поручено изучить технологические пути, способные стимулировать инновации, могущие сделать работу правительства лучше и эффективнее».
Джона Холдрен (John Holdren), директор Белого дома по науке и технической политике, написал в своём блоге, что миссия Чопры завершена. «Аниш справился с этим поручением энергичным, новаторским, удивительно эффективным образом и посеял семена, способствующие продолжению развития нашего правительства в 21-м веке», - подчеркнул он.
Как пишет Washington Post, Чопра, вероятно, будет баллотироваться на должность вице-губернатора штата Вирджиния.
Торговые ассоциации TechAmerica и Business Software Alliance лестно отозвались о службе Чопры в правительстве. По словам президента и исполнительного директора компании TechAmerica Дана Варони (Dan Varroney), технический директор правительства оставил «неизгладимый след в технологической политике этой страны благодаря своей вере в преобразующую природу технологий, активному сотрудничеству между правительством и промышленностью, и его вера будет приносить пользу нашей стране ещё долго после ухода Аниша с его государственного поста».
Президент и исполнительный директор BSA Роберт Холиман (Robert Holleyman) назвал Чопру «неутомимым лидером и защитником» за использование технологий при решении проблем, с которыми сталкивается страна.
До своего назначения в правительство с января 2006 по апрель 2009 года Чопра занимал должность министра по технологиям штата Вирджиния. До этого он работал на посту исполнительного директора компании Advisory Board.