В 2015 году Сергей Парфенов назначен заместителем директорам Фонда развития промышленности (ФРП), который является оператором государственной информационной системы промышленности. Одновременно Парфенов стал непосредственным куратором этого проекта.
До прихода в ФРП он работал в «Ростехе», где возглавляя управление ИТ, отвечал за создание и развитию автоматизированных информационных систем и технической инфраструктуры корпорации и ее дочерних структур.